Mac OSXのiBooksでPDFを開く場合、デフォルトではプレビューで開かれるが、僕の環境ではAcrobat Proが起動する。日本語の縦書き本の場合、本は「右綴じ」なのでAcrobatで見た際の表示は左右逆になる。これを解消するには、PDFのプロパティに持っている「綴じ」の値を右に変更してやれば良い。Command + D → 詳細設定 → 綴じ方 を右に変えて、上書き保存すればOK。